Son olarak hazırladığınız şakşuka harcını, önceden sterilize edilmiş ve kuru olan kavanozların içine sıcak sıcak doldurun. Kavanozların kapaklarını 2 geri 1 ileri yapıp, sıkıca kapatın. Şakşukanın sıcaklığı ile kapaklar vakumlanacaktır. Bu şekilde kavanozları 1 gece tezgah üzerinde bekletin.