Fırında çipura fileto yapımı için, öncelikle 1 adet çipura balığını temizleyip, fileto şeklinde çıkartın. Arzu ederseniz balığınızı aldığınız yere temizletip, fileto çıkarmalarını isteyebilirsiniz. Bu şekilde 1 adet çipura balığından 2 adet fileto elde edeceksiniz. Elde ettiğiniz filetolarda hiç kılçık kalmamasına dikkat edin. Elinizle fileto üzerinde parmağınızı yavaşça gezdirin. Eğer kılçığa denk gelirseniz bir balık cımbızı yardımı ile kılçıklarını temizleyin.